Qu'est-ce que southern blot ?

Le "southern blot" est une technique de biologie moléculaire utilisée pour détecter et analyser les séquences d'ADN spécifiques dans un échantillon. La technique a été développée par le biologiste moléculaire britannique Edwin Southern dans les années 1970 et porte son nom.

Le processus du southern blot commence par la séparation de l'ADN dans un échantillon par électrophorèse sur gel d'agarose. L'ADN est ensuite transféré du gel sur une membrane de nitrocellulose ou de nylon par capillarité ou par transfert électrophorétique (transfert "Southern"), créant une réplique identique de l'ADN sur la membrane.

Une fois que l'ADN est transféré sur la membrane, elle est fixée là-bas par différentes méthodes telles que la chaleur, la lumière UV ou le cross-linking chimique. La membrane est ensuite traitée avec une sonde d'ADN marquée radioactivement ou fluorescente qui est complémentaire de la séquence d'ADN spécifique recherchée. La sonde se lie alors à l'ADN cible présent sur la membrane.

Pour identifier la présence de la séquence cible, la membrane est lavée pour éliminer les sondes non liées, puis exposée à un film radiographique (dans le cas des sondes radioactives) ou analysée à l'aide d'un système de détection approprié (dans le cas des sondes fluorescentes). La présence de bandes foncées sur l'autoradiogramme ou les images fluorescentes indique la présence de la séquence d'ADN cible.

Le southern blot est couramment utilisé en recherche génétique pour détecter des mutations génétiques spécifiques, identifier des gènes spécifiques, confirmer des clones d'ADN recombinant, cartographier des régions d'intérêt dans le génome et étudier la structure des chromosomes. Cependant, cette technique nécessite des échantillons d'ADN relativement importants et prend du temps pour être réalisée. De plus, elle est moins utilisée de nos jours en raison du développement de techniques plus avancées telles que la PCR et le séquençage de l'ADN.

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